《华北水利水电大学学报（自然科学版）》由河南省教育厅主管、华北水利水电大学主办。1980年创刊；2007年由季刊改为双月刊；2014年由《华北水利水电学院学报》更名为《华北水利水电大学学报（自然科学版）》。

《华北水利水电大学学报（自然科学版）》以反映水利水电科研成果为主。其宗旨和任务是宣传党的方针政策和国家关于水电工作的要求，及时报道和传递院内外科研成果、科技新动态，推动水利水电开发事业和国民经济的发展。目前主要栏目有：水利专题报道、水文水资源、治河与防洪、水环境水生态、水工结构和材料、地质工程等。

《华北水利水电大学学报（自然科学版）》于1989年，获河北省科技期刊二等奖。1995年，获河南省自然版学报优秀学报二等奖。1999年，获河南省高校学报优秀期刊一等奖。2000年，获河南省第4届优秀科技期刊三等奖。2002年，获河南省第5届优秀科技期刊二等奖。2003年，被评为《CAJ-CD规范》执行优秀期刊。2009年，获全国高校学报优秀编辑质量奖。2011年，被评为河南省高校学报评估优秀期刊。连续多年被评为河南省一级期刊。已连续四届入选“RCCSE中国核心学术期刊（A-）”。