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《安徽医科大学学报》是安徽医科大学主办的医学综合类学术期刊。主要刊登医学科研、医疗成果和进展的学术性期刊，国内外公开发行。主办单位为安徽医科大学，主管单位为安徽省教育厅。现任主编是著名妇产科学和生殖医学专家曹云霞教授。该刊被美国《化学文摘》（CA）收录、利用。该刊为北京大学图书馆《中文核心期刊要目总览》“综合性医药卫生类核心期刊”、中国科技核心期刊（中国科技论文统计源期刊）、2011年RCCSE核心期刊排行榜A类期刊。亦被中国医学文摘（基础医学、外科学、内科学、儿科学、皮肤科学、肿瘤学、放射诊断、眼科学、耳鼻咽喉科学、口腔医学、检验与临床、护理学、中医、老年学等）、中国药学文摘（CPA）、中国生物学文摘、中文科技资料目录、CSTA、CD-CMCC、Abstracts of Chinese Medicine、中国学术期刊光盘版、中文科技期刊数据库、万方数据库、中国生物医学光盘数据库等20多种国内外检索期刊和数据收录。该刊2003年获国家教育部“全国优秀高等学校自然科学学报及教育部优秀科技期刊二等奖”；2004、2009年安徽省优秀学报、2005年安徽省优秀期刊、2013年华东地区优秀期刊；2002、2005年获安徽省科学技术厅“安徽省优秀科技期刊二等奖”；2009年获“安徽省高等院校优秀学报一等奖”。该刊以原始研究论文为主,反映安徽医科大学在科研、医疗等方面的研究成果和进展;辟有基础医学研究、预防医学研究、药学研究、临床医学研究、技术与方法、经验与体会、综述等栏目。