被美国《医学索引》（Medline/PubMed）收录，在被Medline收录的中国期刊中排名第2位，居我国药学和中医药学期刊首位；被美国《化学文摘（网络版）》（CA），荷兰爱思唯尔数据库（Scopus），美国《生物学文摘（预评）》（BAP），俄罗斯《文摘杂志》（AJ），英国《国际农业与生物科学研究文摘》（CABI），美国《国际药学文摘》（IPA），美国《乌利希期刊指南》（Ulrich PD），《日本科学技术振兴机构中国文献数据库》（JSTChina），《英国皇家化学学会系列文摘》（RSC），英国《全球健康》（GH），荷兰《医学文摘》（EM）等10余家权威性专业文摘或数据库收录。

为“中国科学引文数据库”、“中国学术期刊综合评价数据库”来源期刊，中国自然科学核心期刊，中国中文核心期刊，中国科技核心期刊。

据中国知网（CNKI）“中国科技期刊影响因子年报”公布：《中国中药杂志》总被引频次达到1 5175，影响因子1.404，基金论文比例0.85，下载量达到44.28万次，国内外发行达到机构用户3 000余个。

据中国科学技术信息研究所最新发布的《中国科技期刊引证报告》（核心版）期刊检索统计结果表明：《中国中药杂志》总被引频次为5 961，影响因子0.752，基金论文比0.79。全部指标保持多年持续上升，在我国药学以及中医药学等学科领域科技期刊中均名列前茅。