是中国科学院主管、中国生态学学会和中国科学院沈阳应用生态研究所联合主办的综合性学术期刊，创刊于1990年，由科学出版社出版。本刊开辟有研究论文、综合评述等栏目，内容主要包括森林生态学、农业生态学、草地生态学、渔业生态学、海洋与湿地生态学、资源生态学、景观生态学、全球变化生态学、城市生态学、产业生态学、生态规划与生态设计、污染生态学、化学生态学、恢复生态学、生态工程学、生物入侵与生物多样性保护生态学、流行病生态学、旅游生态学和生态系统管理等。

　　 本刊读者对象主要是从事生态学、地学、林学、农学和环境科学研究、教学、生产的科技工作者，有关专业学生及经济管理和决策部门的工作者。

　　 《应用生态学报》已成为国内外有影响力的中国生态学刊物，入选“中国期刊方阵”（双效期刊）、“中国科技核心期刊”、“中文核心期刊”，被《中国科学引文数据库》（CSCD，核心期刊）、《中国科技论文与引文数据库》（CSTPCD）、《中国学术期刊综合评价数据库》（CAJCED）、《万方数据库》、《中国期刊全文数据库》（GJFD）、《中国学术期刊全文数据库》、《中文科技期刊文摘数据库》、Medline、Scopus、美国《生物学文摘》（BA）、《化学文摘》（CA）、英国《生态学文摘》（EA）、日本《科学技术文献速报》（CBST）和俄罗斯《文摘杂志》（AJ）等国内外十多家权威检索系统和数据库收录。曾获全国优秀科技期刊三等奖（1992年），中国科学院优秀期刊二等奖（1992、1996、2000年）及百种中国杰出学术期刊（2004年）称号。