《南京医科大学学报（自然科学版）》创刊于1956年，月刊，ISSN1007-4368，CN32-1442/R，连续进入《中文核心期刊要目总览》第3、4、5、6、7、8、9版（2000年至今），为中国科学引文数据库（CSCD）来源期刊（2007年—2022）、中国科技论文统计源期刊（中国科技核心期刊），同时被美国《化学文摘》（CA）、美国《乌利希期刊指南》（Ulrich's Periodicals Directory ）、波兰《哥白尼索引》（IC）、《日本科学技术振兴机构中国文献数据库》（JSTChina）等著名检索工具收录。
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