该刊的主要任务是快速报道胃肠病学和肝病学领域的预防，诊断，治疗，康复和护理研究的新理论，新方法和新技术，具体主题内容包括：消化系统发育异常，消化系统遗传性疾病，消化道结构与功能异常，肝胆胰结构与功能异常，腹壁/腹膜结构及功能异常，消化道内环境紊乱、黏膜屏障障碍及相关疾病，消化道动力异常及功能性胃肠病，消化系统内分泌及神经体液调节异常，胃酸分泌异常及酸相关性疾病，胃肠道免疫相关疾病，消化系统血管及循环障碍性疾病，胃肠道及腹腔感染性疾病，肝胆胰免疫及相关疾病，肝脏代谢障碍及相关疾病，药物、毒物及酒精性消化系统疾病，炎性及感染性肝病，肝纤维化、肝硬化与门脉高压症，肝再生、肝保护、肝衰竭和人工肝，胆石成因、胆石症及胆道系统炎症，胰腺外分泌功能异常与胰腺炎，消化系统器官移植，消化系统疾病诊疗新技术，传统医学，中西医结合，循证医学，流行病学，护理和消化系统疾病其他科学问题。与胃肠病学和肝病学相关的应用基础研究，包括免疫学，生理病理学，细胞生物学，药物药理学，医学遗传学和中药药理学等方面的原创性文章和前沿进展。被美国《化学文摘》、荷兰《医学文摘库/医学文摘》和俄罗斯《文摘杂志》等收录。