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《水利水运工程学报》系由国家水利部主管，南京水利科学研究院主办的学术性科技期刊.本刊于1979年创刊，是以涉水工程等为论述主题，面向国内外水利水电、水运交通、海洋和土木工程、水文水资源和水环境等领域的学术性科技期刊.主要反映国内外在水利水电、水运、海洋和土木工程、水文水资源、水环境等领域中科学技术的最新成果、前沿动态、重要进展和发展趋势；本刊内容涉及的学科和研究方向主要有：水工水力学、枢纽及环境水力学、高坝通航水力学、渗流水力学、核技术应用、泥沙运动基本理论、河流、河口海岸动力学、港口和近海工程、岩土力学基本理论、高土石坝筑坝技术、土与结构物相互作用、地基处理与加固、地质/地震灾害成因分析及防止、水工结构耐久性、水工建筑物病害评估和修复技术、高性能水工新材料、生态性环境友好材料与废渣综合利用、水文学理论与方法、防洪抗旱与减灾、水资源可持续利用、水资源配置与管理、水环境与水生态、大坝安全与管理、大坝病险机理安全诊断与风险评估等.

本刊被《中文核心期刊要目总览》连续5版确认为水利工程类核心期刊，并被国内外多家数据库收录.