《上海海洋大学学报》（原《上海水产大学学报》）创刊于1992年，是由上海市教委主管、上海海洋大学主办，以海洋、水产科学技术为主的综合性学术期刊。主要刊载水产生物技术、水产养殖、水产营养与饲料、水域环境与保护、渔业资源与管理、远洋渔业、水产品加工技术、海洋物理、海洋工程、海洋信息等学科的论文和综述，促进了学术与教学研究的交流与繁荣。至2023年《上海海洋大学学报》已出版了32卷，期页码为220页。

《上海海洋大学学报》作为文献源被Scopus数据库、EBSCO数据库、《化学文献》（CA）、俄罗斯《文摘杂志》（AJ,VINITI）、日本《CBST 科学技术文献速报》、《水科学和渔业文摘》（ASFA）、《剑桥科学文摘》（CSA）、《中国科学引文数据库（CSCD）》、《中国生物学文摘》、《中国水产文摘》等众多国内外检索期刊收录。

2021年获得“第四届上海市高校精品科技期刊”；2022年获得“中国高校百佳科技期刊”；2023年获得度中国农业期刊优秀团队。