《华北水利水电大学学报（自然科学版）》由河南省教育厅主管、华北水利水电大学主办。1980年创刊；2007年由季刊改为双月刊；2014年由《华北水利水电学院学报》更名为《华北水利水电大学学报（自然科学版）》。

《华北水利水电大学学报（自然科学版）》始终坚持 “彰显水利特色、提升学术质量” 的核心理念。办刊宗旨为：贯彻落实 “十六字” 治水思路的要求，围绕新时代水利事业改革的需求，及时报道国内外水科学领域最新高水平学术研究成果，加强学术交流，助推新阶段水利高质量发展。刊载范围主要有：黄河流域生态保护和高质量发展、南水北调后续工程高质量发展、数字孪生水利、智慧水利、水旱灾害防御、水文水资源、水环境、水工结构、地质工程、土木工程等。

《华北水利水电大学学报（自然科学版）》为中文核心期刊（2020年版、2023年版），中国科技核心期刊（2020年、2021年、2022年、2023年），RCCSE中国核心学术期刊（A）（2020年）。入选《科技期刊世界影响力指数（WJCI）报告》（2021年、2022年、2023年）。获评河南优秀出版奖期刊奖（2022年度），河南省高校学报评估优秀期刊（2011年），全国高校学报优秀编辑质量奖（2009年）。连续多年被评为河南省一级期刊。