学报原名《安徽卫生职业技术学院学报》，国内统一连续出版物号为CN 34—1213/Z，国际标准连续出版物号为ISSN 1671—8054。更名为《安徽医专学报》后，新编国内统一连续出版物号为CN 34—1337/R, 国际标准连续出版物号为ISSN 2097-0196；主管单位名称变更为安徽省卫生健康委员会，出版单位名称随刊名而变更；原学报的办刊宗旨和办刊学科定位不变，继续致力于医学教育、医疗卫生工作科研和学术交流服务，以科研求真知，以交流促进步。

在各级主管部门和学校党委的领导和支持下，我校原《安徽卫生职业技术学院学报》自2002年8月创刊，至更名时已编辑出版20卷113期。坚持医学综合性学术期刊的办刊定位，不断创新办刊思路，开门办刊，面向国内外医疗卫生单位和医学院校组稿；适时调整栏目设置，加强临床医学、护理学、医学教育与教学研究等重点栏目和生育与妇幼卫生、卫生技术、公共卫生研究等特色栏目建设，加强优质稿件的征集组织；不断加强编辑队伍建设，完善审稿、编辑和出版制度、流程，严格执行责任编辑执证上岗和“三审三校”等期刊编辑出版制度，不断加强意识形态管理，强化期刊的学术水平和编辑出版质量，使学报的学术水平和编辑出版质量不断显著提高。读者、作者明确而广泛，遍及全国30余个省、自治区、直辖市和特别行政区及海外10余个国家和地区。影响因子、他引率等评价指标居同类期刊前列，顺利获得国家新闻出版广电总局首批“A类学术期刊”认定（2014年）；多次荣获全国和省行业学会、主管部门评授的高校“优秀学报”（2006、2008、2011年）、“编校质量奖”（2014年）、“特色栏目奖”（2017年）、“安徽省优秀期刊”（2020年） 、“华东地区期刊优秀栏目奖”（2020年） 及“优秀主编”“优秀编辑”等多种表彰。2017、2020年连续获得《中国学术期刊评价研究报告》（武大版/中国四大核心期刊评价之一）的“RCCSE中国高职高专成高院校学报类核心期刊（A）”评价（且在同类期刊中分别排名第六、第七）。